يعتبر المنتخب المصرى صاحب المقام الرفيع فى بطولة كأس الأمم الإفريقية، منذ انطلاق النسخة الأولى عام 1957 فى السودان، حيث لم يكتف الفراعنة بأن كانوا أحد الرواد وأصحاب الفضل فى تدشين هذا الحدث الرياضى الأول على مستوى القارة مع السودان وإثيوبيا وجنوب إفريقيا، ولكن الفريق نجح فى الفوز بأكبر عدد من البطولات، حين احتكر الكأس الغالية 7 مرات ليدخل التاريخ من أوسع أبوابه.
تاريخ كأس الأمم ارتبط بتاريخ مصر التى تمتلك الرقم القياسى فى عدد مرات المشاركة بالبطولة، برصيد 22 مشاركة بفارق بطولتين عن غانا الثانى، حيث لم تغب شمس الكرة المصرية عن البطولة إلا فى 8 بطولات فقط وهو الفريق الأكثر نجاحًا فى مشاركاته، إذ حقق المركز الثانى مرة عام 1962 بإثيوبيا والمركز الثالث 3 مرات فى 1963 بغانا و1970 بالسودان و1974 بمصر، وحل رابعًا 3 مرات فى 1976 بإثيوبيا و1980 بنيجيريا و1984 بكوت ديفوار.
أما أسوأ المشاركات المصرية فى البطولة، فكانت فى المغرب 1988 والجزائر 1990 والسنغال 1992 وتونس 2004 حيث لم يتخط الفريق حدود دورى المجموعات.
فى حين كانت المشاركة الأسوأ بتاريخ المنتخب فى النهائيات عام 1990 التى أقيمت فى بلد المليون شهيد، حيث خسر الفريق المباريات الثلاث أمام كوت ديفوار 3 ـ 1 وأمام نيجيريا بهدف وأمام الجزائر بهدفين نظيفين، ومن المثير أنه فى هذه السنة شارك المنتخب الوطنى فى كأس العالم بإيطاليا وقدم عروضًا قوية، وتعادل مع هولندا بهدف مجدى عبدالغنى الشهير حيث كان المنتخب الهولندى هو بطل أوروبا، وقتذاك ورغم أنه فى بطولة 1992 بالسنغال خسر المنتخب ولم يفز أو يتعادل ولكنه لعب 3 مباريات فقط ما يعنى أنه خسر مرتين فقط أمام زامبيا وغانا بنتيجة واحدة هى 1 ـ 0.
واكتفى الفراعنة بالتأهل إلى دور الثمانية فى تونس 1994 وجنوب إفريقيا 1996 وغانا ونيجيريا 2002 ومالى 2002.
وإذا كان المنتخب الوطنى قد غاب عن بطولة كأس الأمم الإفريقية 8 مرات، فإنه لم يخفق فى التصفيات إلا 6 مرات فقط. ففى عام 1965 انسحب من البطولة بسبب وجود أزمة سياسية بين مصر وتونس فى ذلك الوقت، بعد أن كان الفراعنة ضمن قائمة الفرق المتأهلة إلى البطولة.
وفى عام 1968 كان من المفترض أن تلتقى مصر بأوغندا فى التصفيات ولكنها انسحبت فى أعقاب نكسة 5 يونيو 1967.
وفى تصفيات بطولة 1972 خسرت مصر أمام المغرب وأخفقت لأول مرة فى التأهل إلى النهائيات لأسباب غير سياسية، وفى تصفيات بطولة 1978 خسرت مصر أمام تونس لتودع التصفيات.
وفى عام 1981 انسحبت مصر أمام تونس لأسباب سياسية وذلك بعد الفوز على كينيا بنتيجة كبيرة قوامها 7 ـ 3 فى مجموع جولتى الذهاب والإياب، وأخفق المنتخب الوطنى فى التأهل إلى النهائيات فى بطولات 2012 بغينيا الاستوائية والجابون و2013 فى جنوب إفريقيا و2015 فى غينيا الاستوائية قبل العودة من جديد مع الأرجنتينى هيكتور كوبر المدير الفنى الحالى.